新湖南獨(dú)家丨湖南疾控已完成20例新冠病毒標(biāo)本測(cè)序，均為德?tīng)査局辏c南京高度同源
湖南日?qǐng)?bào)·新湖南客戶端8月2日訊 (記者 張春祥 通訊員 張亞娜 李世康) 記者今日獲悉，自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例標(biāo)本以來(lái)，湖南省疾控中心已完成20例德?tīng)査鹿诓《净蚪M測(cè)序。已經(jīng)完成測(cè)序結(jié)果的標(biāo)本均為德?tīng)査局�，與南京高度同源。
5天時(shí)間已完成20例標(biāo)本測(cè)序
據(jù)省疾控中心檢驗(yàn)科科長(zhǎng)湛志飛介紹，基因組測(cè)序可在第一時(shí)間獲取新發(fā)未知病毒的基因組序列信息，已成為研究疾病暴發(fā)的重要工具。通過(guò)構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)，研究不同患者病毒遺傳序列變化，能在分子生物學(xué)層面揭示病毒的傳播方式，分析新冠病毒的進(jìn)化來(lái)源，研究新冠病毒的致病病理機(jī)制，為控制疫情暴發(fā)提供科學(xué)依據(jù)。
通過(guò)檢測(cè)新冠病毒的全基因組序列，再將這個(gè)序列通過(guò)算法與數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì)，可以初步判斷其地域來(lái)源。將序列與既往病例序列進(jìn)行比對(duì)，如果序列在同一進(jìn)化樹(shù)分支上，則可以判斷這些病例是否來(lái)自同一傳播鏈或傳染源。
面對(duì)此次疫情，從7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例標(biāo)本以來(lái)，湖南省疾控已完成20例標(biāo)本測(cè)序。
24小時(shí)完成病毒基因測(cè)序溯源
“新冠病毒樣本送到實(shí)驗(yàn)室后，一般需要經(jīng)過(guò)多個(gè)步驟完成檢測(cè)�！闭恐撅w稱，在接到陽(yáng)性樣本后，工作人員首先進(jìn)行復(fù)核工作，對(duì)樣本進(jìn)行核酸提取，再用兩種試劑進(jìn)行核酸檢測(cè)。復(fù)核陽(yáng)性的標(biāo)本，分別用二代和三代高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行序列測(cè)定，為病毒溯源工作設(shè)置“雙保險(xiǎn)”，確保萬(wàn)無(wú)一失。
病毒基因序列測(cè)定完成后，工作人員還要馬上進(jìn)行生物信息學(xué)分析，將病毒序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列進(jìn)行比對(duì)，查看有無(wú)變異位點(diǎn)，進(jìn)行同源性比較。完成數(shù)據(jù)比對(duì)后，還要及時(shí)撰寫溯源報(bào)告。
“目前，湖南省疾控中心已具備新冠病毒基因組高通量二代和三代測(cè)序能力，為湖南省新型冠狀病毒疫情以及其他傳染病病原體的鑒定和溯源、防控應(yīng)對(duì)提供了強(qiáng)大的技術(shù)支撐�！闭恐撅w介紹，去年10月份才掌握這項(xiàng)技術(shù)，以前都是送到國(guó)家疾控中心檢測(cè)。目前湖南省疾控中心培養(yǎng)了3名技術(shù)骨干，所有的新冠病毒基因組測(cè)序都能在24小時(shí)內(nèi)完成，情況復(fù)雜的也不會(huì)超過(guò)48小時(shí)。根據(jù)疫情的變化，只要有標(biāo)本來(lái)，都會(huì)在24小時(shí)內(nèi)啟動(dòng)測(cè)序流程。
測(cè)序結(jié)果與南京高度同源
7月28日，接到2021年第一例本土新冠肺炎病例標(biāo)本測(cè)序工作以來(lái)，省疾控中心立即組織專業(yè)技術(shù)人員，日夜不停地開(kāi)展測(cè)序工作，通過(guò)文庫(kù)制備、簇生成、上機(jī)測(cè)序與數(shù)據(jù)比對(duì)分析，已經(jīng)完成測(cè)序結(jié)果的標(biāo)本均為德?tīng)査局�。從�?guó)家疾控中心反饋的結(jié)果顯示，和江蘇省報(bào)送的南京疫情本土病例新冠病毒基因組序列高度同源。
根據(jù)最新疫情通報(bào)，2021年7月20日0時(shí)至8月1日24時(shí)，湖南省累計(jì)報(bào)告新型冠狀病毒肺炎確診病例22例(境外輸入3例)。此次疫情病原體為德?tīng)査儺愔�，范圍廣、來(lái)勢(shì)猛，廣大民眾一定不能掉以輕心，嚴(yán)格執(zhí)行好持碼進(jìn)出、測(cè)量體溫、佩戴口罩、保持距離等措施，有效降低病毒傳播風(fēng)險(xiǎn)，減少不必要的人員聚集。
